Program studi D III – Teknik Mesin berfokus pada pengembangan keterampilan teknis di bidang teknik mesin. Program studi ini dirancang untuk memenuhi kebutuhan dunia industri akan tenaga kerja terampil yang mampu melakukan perancangan, produksi, pengoperasian, dan perawatan mesin-mesin industri.

Program studi ini dirancang untuk mengatasi tantangan pencemaran lingkungan melalui pendekatan praktis yang berfokus pada solusi nyata. Dengan perpaduan antara teori dan praktik, program ini bertujuan untuk menghasilkan lulusan yang kompeten dalam menganalisis, merumuskan, dan menerapkan strategi guna mengatasi berbagai permasalahan lingkungan.

Program Studi Pengembangan Produk Agroindustri didirikan untuk memenuhi kebutuhan tenaga kerja terampil bidang agroindustri subsektor pengolahan yang setiap tahun mengalami peningkatan.

Program Studi Teknologi Rekayasa Energi Terbarukan (TRET) Politeknik Negeri Cilacap (PNC) memiliki tujuan untuk menyiapkan mahasiswa menjadi tenaga ahli yang profesional dalam menerapkan, mengembangkan dan menyebarluaskan Teknologi Energi Terbarukan khususnya teknologi energi angin, surya dan air.